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  3. MARCELO RUBEN CAPAROTTA
Comunidad CONICET

CAPAROTTA, MARCELO RUBEN

POSTDOCTORAL (INTERNA)

ESPECIALIDAD:

Química Computacional

Disciplina Científica:

Ciencias Quimicas - Informática y Comunicaciones

Tema:

Desarrollo de Modelos Computacionales para la Generación de Ligandos Basados en IA y Dinámica Molecular.

Lugar de Trabajo

INSTITUTO DE HISTOLOGIA Y EMBRIOLOGIA DE MENDOZA DR. MARIO H. BURGOS (IHEM, CONICET-UNCU) Depende de
Dirección:
EDIFICIO IHEM CENTRO UNIVERSITARIO S/N, M5502JMA - Mendoza - Argentina

Contacto:

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Experticia en CyT*

Como licenciado en sistemas de información y con el doctorado especializado en química computacional me he dedicado al estudio de las interacciones entre lípidos y proteínas, -particularmente durante eventos biológicos de interés como la curvatura de las bicapas y su fusión, la nucleación y la expansión de poros de fusión en membranas de diferentes composiciones lipídicas- realizando simulaciones de dinámica molecular (GROMACS, AMBER, OpenMM) con campos de fuerza atomísticos y de grano grueso (Martini). He desarrollado variables colectivas (PLUMED, C++, Python) para inducir la formación de poros de fusión y calcular la energía libre (umbrella sampling, metadinámica). He estudiado el plegamiento de proteínas utilizando una herramienta propia del laboratorio (MELD) -que incluye Intercambio de Réplicas de Dinámica Molecular (H,T REMD) e Inferencia Bayesiana- a la cual incorporé Aceleración Gaussiana (GaMD). *Información suministrada por el agente en SIGEVA

Líneas de Investigación

Química Computacional Ciencias naturales y exactas - Ciencias biológicas - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)

Capacidades Tecnológicas

  • 5. Ciencias físicas y exactas
    • 1. Química
      • 1.2. Química computacional y modelado
  • 6. Ciencias biológicas
    • 1. Medicina, Salud humana
      • 1.13. Productos farmacéuticos / medicamentos
    • 2. Biología / Biotecnología
      • 2.6. Diseño molecular

Palabras Clave

Química ComputacionalSimulaciones de Dinámica MolecularMétodos de muestreo mejoradoCampo de fuerza de grano gruesoPoros de fusionPlegamiento de proteínasInteracciones lípido-proteínaComputational ChemistryMolecular Dynamics SimulationsEnhanced Sampling methodsCoarse-Grained Force FieldFusion poresProtein foldingProtein-Lipid Interactions

Formación Académica

2018 - 2022

Doctor en Ciencia y Tecnología

FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS Y NATURALES, UNIVERSIDAD NACIONAL DE CUYO

1999 - 2004

Licenciado en Sistemas de Información

UNIVERSIDAD CHAMPAGNAT


Dirigido por
MASONE, DIEGO FERNANDO
Carrera Investigador

Producción CyT

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Oferta Tecnológica

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