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Comunidad CONICET

CARBALLO, JOSÉ

POSTDOCTORAL (INTERNA)

ESPECIALIDAD:

Bioinformatica

Disciplina Científica:

Ciencias Agrarias - Ciencias Agrarias

Tema:

Análisis de la expresión diferencial de genes durante el desarrollo reproductivo de Eragrostis curvula en busca de las vías moleculares involucradas en la apomixis . Diferential gene expression analisis during the Eragrostis curvula reproduction development in order to find the molecular pathway involved in apomixis.

Lugar de Trabajo

CENTRO DE RECURSOS NATURALES RENOVABLES DE LA ZONA SEMIARIDA (CERZOS, CONICET-UNS) Depende de
Dirección:
CAMINO LA CARRINDANGA KM 7E1, B8000CPB - Bahía Blanca - Buenos Aires - Argentina

Contacto:

Enviar Mensaje

Experticia en CyT*

Durante el curso de Doctorado adquirí la habilidad de trabajar con el SO Linux para el análisis de datos genómicos, transcriptomicos y epigenomicos. El principal objetivo de estos análisis fue la identificación de la región ligada a al apomixis en el genoma de Eragrostis curvula y el estudio del contenido de los elementos regulatorios que contiene. Se hicieron análisis comparativos de genotipos con distinto modo reproductivo y ploidía. Para ello se secuenciaron bibliotecas de RNA-seq, ADN, genotipado por secuenciación, secuenciación de ADN y regiones diferencialmente metiladas. Para el análisis de todos estos datos desarrolle experiencia en programas bioinformáticos específicos para cada una de estas técnicas y en leguajes de programación como R, python y Perl. Los proyectos de secuenciación de ADN y ARN requirieron que me forme en el campo del ensamblado y la anotación de genomas y transcriptomas. Para ello, en múltiples ocasiones realice pasantías en el instituto NIAB de Reino Unido el cual cuenta con una amplia trayectoria en el campo de la bioinformática. *Información suministrada por el agente en SIGEVA

Líneas de Investigación

Bioinformatica CIENCIAS AGRÍCOLAS - Biotecnología Agropecuaria - Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria

Palabras Clave

BioinformaticaapomixisEragrostisBioinformatic

Formación Académica

2016 - 2021

Doctor en Agronomía

UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR

2006 - 2013

Ingeniero Agronomo

UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR


Dirigido por

Producción CyT

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