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Comunidad CONICET
CARBALLO, JOSÉ

Investigador asistente

Especialidad
Bioinformatica
Disciplina Científica
Ciencias Agrarias - Ingeniería de alimentos y Biotecnología
Tema
Secuenciación y ensamblado del genoma de Eragrostis curvula con el fin dilucidar la regulación genética y epigenética de la apomixis
Lugar de Trabajo
CENTRO DE RECURSOS NATURALES RENOVABLES DE LA ZONA SEMIARIDA (CERZOS, CONICET-UNS)
Depende de
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Dirección:
CAMINO LA CARRINDANGA KM 7E1, B8000CPB - Bahía Blanca - Buenos Aires - Argentina
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Resumen Información suministrada por el agente en SIGEVA
Durante el curso de Doctorado adquirí la habilidad de trabajar con el SO Linux para el análisis de datos genómicos, transcriptomicos y epigenomicos. El principal objetivo de estos análisis fue la identificación de la región ligada a al apomixis en el genoma de Eragrostis curvula y el estudio del contenido de los elementos regulatorios que contiene. Se hicieron análisis comparativos de genotipos con distinto modo reproductivo y ploidía. Para ello se secuenciaron bibliotecas de RNA-seq, ADN, geno... Durante el curso de Doctorado adquirí la habilidad de trabajar con el SO Linux para el análisis de datos genómicos, transcriptomicos y epigenomicos. El principal objetivo de estos análisis fue la identificación de la región ligada a al apomixis en el genoma de Eragrostis curvula y el estudio del contenido de los elementos regulatorios que contiene. Se hicieron análisis comparativos de genotipos con distinto modo reproductivo y ploidía. Para ello se secuenciaron bibliotecas de RNA-seq, ADN, genotipado por secuenciación, secuenciación de ADN y regiones diferencialmente metiladas. Para el análisis de todos estos datos desarrolle experiencia en programas bioinformáticos específicos para cada una de estas técnicas y en leguajes de programación como R, python y Perl. Los proyectos de secuenciación de ADN y ARN requirieron que me forme en el campo del ensamblado y la anotación de genomas y transcriptomas. Para ello, en múltiples ocasiones realice pasantías en el instituto NIAB de Reino Unido y el cual cuenta con una amplia trayectoria en el campo de la bioinformática.
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Líneas de Investigación

Bioinformatica

Ciencias agrícolas

  • Biotecnología agropecuaria
  • Biotecnología agrícola y biotecnología alimentaria

Bioinformatica

Ciencias agrícolas

  • Biotecnología agropecuaria
  • Biotecnología agrícola y biotecnología alimentaria
Palabras Clave
BioinformaticaapomixisEragrostisBioinformatic
Formación Académica

2016 - 2021

Doctor en Agronomía

UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR

2006 - 2013

Ingeniero Agronomo

UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR

Formación de RRHH
Dirigido por:
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