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Tesis
Autoría
Fecha
31/03/2008
Resumen
Información suministrada por el agente en
SIGEVA
La podredumbre seca es una enfermedad que afecta a los tubérculos de papa (Solanum tuberosum L. spp tuberosum) y es causada por el hongo fitopatógeno Fusarium eumartii. A partir del análisis diferencial de una biblioteca de ADNc de tubérculos de papa heridos e inoculados con el hongo durante 24 hs, contamos en nuestro laboratorio, con alrededor de 450 ADNc de papa diferenciales, secuenciados e identificados. Sin embargo aún restan identificar un número ...
La podredumbre seca es una enfermedad que afecta a los tubérculos de papa (Solanum tuberosum L. spp tuberosum) y es causada por el hongo fitopatógeno Fusarium eumartii. A partir del análisis diferencial de una biblioteca de ADNc de tubérculos de papa heridos e inoculados con el hongo durante 24 hs, contamos en nuestro laboratorio, con alrededor de 450 ADNc de papa diferenciales, secuenciados e identificados. Sin embargo aún restan identificar un número importarte de clones, así como también confirmar la expresión diferencial de todos ellos. En este trabajo, en primer lugar, se completó la identificación de los clones de ADNc de papa. Se realizaron amplificaciones por PCR a partir de las suspensiones de las fagos y los productos fueron purificados y secuenciados. Mediante la búsqueda de homologías en las bases de datos se logró identificar 74 nuevos ADNc de papa. La clasificación en categorías funcionales reveló que las más representadas fueron ?Proceso Biológico Desconocido? (30%) y ?Metabolismo? (27%) seguidas de ?Interacción con el Ambiente? (12%), ?Defensa Celular? (8%) y ?Transcripción? (7%). Posteriormente para confirmar la expresión diferencial de todos los ADNc identificados (508) se generó un macroarreglo. La optimización de una reacción de PCR permitió la reamplificación del 70% de los clones de ADNc de papa, que fueron impresos en el macroarreglo. Actualmente se están llevando a cabo las hibridaciones con las sondas complejas en la sección de CHIPS-SCSIE de la Universidad de Valencia, España, y esperamos contar con los resultados a la brevedad. El macroarreglo producido en este trabajo no solo confirmará la expresión diferencial de los clones de ADNc de papa sino que aportará nueva información para la compresión del defensoma de papa.Paralelamente y a fin de ampliar los estudios de expresión de un grupo de clones de ADNc se realizó un análisis in silico. El análisis del patrón de expresión de estos clones frente a otros tipos de estrés sugiere que estos ADNc que potencialmente se expresan frente a herida y F. eumartii también se estarían expresando frente a otros tipos de estreses. Los resultados obtenidos en este trabajo brindan una valiosa información para la comprensión de la respuesta de defensa de los tubérculos de papa frente a condiciones de estrés.
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Palabras Clave
SOLANUM TUBEROSUMMACROARRAYFUSARIUM EUMARTII