Effect of urea over hydrophobic aggregates

Articulo

Resumen *

A fines de contribuir al entendimiento del mecanismo por el cual se desnaturaliza una proteína en el presente trabajo analizamos mediante simulaciones computacionales la formación de agregados en una mezcla binaria de partículas no polares en agua y los cambios que se producen en los agregados y en la estructura del agua del sistema cuando le agregamos urea a la mezcla binaria. Los resultados nos muestran que la presencia de la urea produce una disminución en el tamaño promedio de los agregados de partículas no polares, lo cual dada la simpleza del sistema inicial solo puede interpretarse en términos de una disminución de la interacción hidrofobica. De manera complementaria analizamos la función de distribución radial para el agua en cada uno de los sistemas observándose resultados compatibles con la idea de que la presencia de la urea contribuye a fortalecer la estructura del agua. Todos los sistemas fueron simulados utilizando Dinámica Molecular como técnica central, ajustando los baños de temperatura y presión a 300 K y 1 bar respectivamente. Información suministrada por el agente en SIGEVA