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GENERALIZACION DE LA DIVERGENCIA DE JENSEN SHANNON A ESTADISTICA NO EXTENSIVA PARA EL ANALISIS DE SECUENCIAS

Artículo

Autoría
BUSSANDRI, DIEGO ; Leonel Garro Linck ; Miguel Ré ; Pedro Lamberti
Fecha
2013
Editorial y Lugar de Edición
Asociación Física Argentina
Revista
Anales AFA, vol. 24 (pp. 113-118) Asociación Física Argentina
Resumen Información suministrada por el agente en SIGEVA
La divergencia de Jensen Shannon (JSD), una versión simetrizada de la divergencia de Kullback Leibler,permite cuantificar la diferencia entre distribuciones de probabilidad. Debido a esta propiedad ha sido ampliamente utilizada para el análisis de secuencias simbólicas, comparando la composición simbólica de posibles subsecuencias. Una ventaja que ofrece JSD es que no requiere el mapeo de la secuencia simbólica a una secuencia numérica, necesaria... La divergencia de Jensen Shannon (JSD), una versión simetrizada de la divergencia de Kullback Leibler,permite cuantificar la diferencia entre distribuciones de probabilidad. Debido a esta propiedad ha sido ampliamente utilizada para el análisis de secuencias simbólicas, comparando la composición simbólica de posibles subsecuencias. Una ventaja que ofrece JSD es que no requiere el mapeo de la secuencia simbólica a una secuencia numérica, necesaria por ejemplo en el análisis de correlación espectral. Se han propuesto distintas extensiones de JSD para mejorar la detecci´on de bordes de subsecuencias en una secuencia, en particular para el análisis de secuencias de DNA. Desde su propuesta original, la extensión propuesta por Tsallis a la entropía de Boltzmann Gibbs ha sido considerada para extender sus resultados y aplicaciones. Sin embargo no surge una única posibilidad para la extensión de JSD a partir de la definición de Tsallis. Consideramos aquí posibles extensiones de la JSD en el marco de la entropía de Tsallis y consideramos los resultados que se obtienen cuando se aplican al análisis de secuencias simbólicas para la detección de bordes de subsecuencias.
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Palabras Clave
SegmentaciónEntropía no extensivaJensen-ShannonDistancias entrópicas