CONICET Community
CARBALLO, JOSÉ
Assistant researcher
SPECIALITY:
BioinformaticaScientific discipline:
Agrarian Sciences - Food engineering and BiotechnologyTopic:
Sequencing and assembly of the Eragrostis curvula genome to disclose the genetic and epigenetic regulation of apomixis.Workplace
CENTRO DE RECURSOS NATURALES RENOVABLES DE LA ZONA SEMIARIDA (CERZOS, CONICET-UNS) Depends on
- CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS (CONICET)
- UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR (UNS)
| Address: | |
| CAMINO LA CARRINDANGA KM 7E1, B8000CPB - Bahía Blanca - Buenos Aires - Argentina |
Contact:
S&T Expertise*
Durante el curso de Doctorado adquirí la habilidad de trabajar con el SO Linux para el análisis de datos genómicos, transcriptomicos y epigenomicos. El principal objetivo de estos análisis fue la identificación de la región ligada a al apomixis en el genoma de Eragrostis curvula y el estudio del contenido de los elementos regulatorios que contiene. Se hicieron análisis comparativos de genotipos con distinto modo reproductivo y ploidía. Para ello se secuenciaron bibliotecas de RNA-seq, ADN, genotipado por secuenciación, secuenciación de ADN y regiones diferencialmente metiladas. Para el análisis de todos estos datos desarrolle experiencia en programas bioinformáticos específicos para cada una de estas técnicas y en leguajes de programación como R, python y Perl. Los proyectos de secuenciación de ADN y ARN requirieron que me forme en el campo del ensamblado y la anotación de genomas y transcriptomas. Para ello, en múltiples ocasiones realice pasantías en el instituto NIAB de Reino Unido y el cual cuenta con una amplia trayectoria en el campo de la bioinformática. *Information provided by the agent in SIGEVALines of Investigation
Bioinformatica
Agricultural sciences - Agricultural biotechnology - Agricultural biotechnology and food biotechnology
Bioinformatica
Agricultural sciences - Agricultural biotechnology - Agricultural biotechnology and food biotechnology
Key Words
BioinformaticaapomixisEragrostisBioinformatic
Education
2016 - 2021
Doctor en Agronomía
UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR
2006 - 2013
Ingeniero Agronomo
UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR
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