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CARBALLO, JOSÉ
POSTDOCTORAL (INTERNA)
SPECIALITY:
BioinformaticaScientific discipline:
Ciencias Agrarias - Ciencias AgrariasTopic:
Análisis de la expresión diferencial de genes durante el desarrollo reproductivo de Eragrostis curvula en busca de las vías moleculares involucradas en la apomixis . Diferential gene expression analisis during the Eragrostis curvula reproduction development in order to find the molecular pathway involved in apomixis.Workplace
CENTRO DE RECURSOS NATURALES RENOVABLES DE LA ZONA SEMIARIDA (CERZOS, CONICET-UNS) Depends on
- CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS (CONICET)
- UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR (UNS)
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| CAMINO LA CARRINDANGA KM 7E1, B8000CPB - Bahía Blanca - Buenos Aires - Argentina |
Contact:
S&T Expertise*
Durante el curso de Doctorado adquirí la habilidad de trabajar con el SO Linux para el análisis de datos genómicos, transcriptomicos y epigenomicos. El principal objetivo de estos análisis fue la identificación de la región ligada a al apomixis en el genoma de Eragrostis curvula y el estudio del contenido de los elementos regulatorios que contiene. Se hicieron análisis comparativos de genotipos con distinto modo reproductivo y ploidía. Para ello se secuenciaron bibliotecas de RNA-seq, ADN, genotipado por secuenciación, secuenciación de ADN y regiones diferencialmente metiladas. Para el análisis de todos estos datos desarrolle experiencia en programas bioinformáticos específicos para cada una de estas técnicas y en leguajes de programación como R, python y Perl. Los proyectos de secuenciación de ADN y ARN requirieron que me forme en el campo del ensamblado y la anotación de genomas y transcriptomas. Para ello, en múltiples ocasiones realice pasantías en el instituto NIAB de Reino Unido el cual cuenta con una amplia trayectoria en el campo de la bioinformática. *Information provided by the agent in SIGEVALines of Investigation
Bioinformatica
CIENCIAS AGRÍCOLAS - Biotecnología Agropecuaria - Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria
Key Words
BioinformaticaapomixisEragrostisBioinformatic
Education
2016 - 2021
Doctor en Agronomía
UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR
2006 - 2013
Ingeniero Agronomo
UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR
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