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PAOLINELLI, MARCOS

INVESTIGADOR ASISTENTE

SPECIALITY:

Caracterización de la diversidad microbiana mediante técnicas moleculares

Scientific discipline:

Ciencias Agrarias - Bioquímica y Biología Molecular

Topic:

CARACTERIZACIÓN DEL MICROBIOMA Y SU DINÁMICA EN LA RELACIÓN SUELO-PLANTA-FERMENTACIÓN PARA EL DESARROLLO DE UNA PRODUCCIÓN VITIVINÍCOLA SUSTENTABLE . Soil microbiome characterization through high throughput sequencing for microbial terroir determination and diseases prevention on vitiviniculture

Workplace

CENTRO DE ESTUDIOS ENOLOGICOS Depends on
  • INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGIA AGROPECUARIA (INTA)
    • CENTRO REGIONAL MENDOZA-SAN JUAN (CR MENDOZA-SAN JUAN)
      • ESTACION EXPERIMENTAL AGROPECUARIA MENDOZA (EEA MENDOZA)
Address:
SAN MARTIN 3855, 5507 - MAYOR DRUMMOND'S - Mendoza - Argentina

Contact:

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S&T Expertise*

Tengo experiencia en proyectos relacionados a las interacciones entre microorganismos y plantas, tanto aquellas de beneficio para ambas partes (rizobio-leguminosa), como las que causan un deterioro de la planta hospedadora (hongos de la familia Botrysophaeriaceae con vid). Durante estos proyectos puse en práctica técnicas de microbiología, biología molecular, bioquímica y bioinformática; como por ejemplo FPLC, HPLC, microscopía óptica, PCR, qPCR, RT-qPCR, RNAseq y metagenómica. En el doctorado profundicé más en la bioinformática, para lo cual utilicé los últimos desarrollos de software libre en Linux, lenguajes de programación en R, Perl y Python, así como el uso de clusters computacionales. En el postdoctorado lleve a cabo la caracterización del microbioma de plantas de vid cv. Malbec a partir de un enfoque metatranscriptómico. Actualmente estoy haciendo usando secuenciación de ONT (Oxford Nanopore Technologies) para lac caracterización del microbiomade suelo y vino *Information provided by the agent in SIGEVA

Lines of Investigation

Caracterizción del microbioma en plantas de vid cv. Malbec CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Biología Celular, Microbiología
Caracterización morfológica y molecular de hongos asociados a enfermedades de la madera en vid CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Micología
Transcriptómica y expresión génica en hongos CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)
Caracterización del microbioma en vino CIENCIAS AGRÍCOLAS - Biotecnología Agropecuaria - Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria

Technological Capacities

  • 6. Ciencias biológicas
    • 2. Biología / Biotecnología
      • 2.1. Bioquímica / biofísica
      • 2.2. Biología celular y molecular
      • 2.4. Ensayos in vitro, experimentos
      • 2.5. Microbiología
      • 2.9. Tecnología de enzimas
      • 2.11. Ingeniería de proteínas
    • 3. Investigación del genoma
      • 3.1. Bioinformática
      • 3.2. Expresión genética, investigación proteómica
      • 3.3. Genética poblacional
    • 4. Micro- y nanotecnología relacionada con las ciencias biológicas
  • 7. Agricultura y recursos marinos
    • 1. Agricultura
      • 1.3. Biocontrol
      • 1.7. Agricultura de precisión

Key Words

bioinformáticatranscriptomatranscriptomeenfermedades de la madera de vidmicrobiomamicrobiomegrapevine trunk diseasesbioinformaticssecuenciación con Tecnología ONTONT sequencing

Education

2012 - 2016

Doctor en Ciencias de la Vida con orientación en Microbiología

CICESE

2009 - 2011

Maestro en Biotecnología

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DEL ESTADO DE MORELOS

2001 - 2008

Licenciado en Biotecnología

FACULTAD DE CS.BIOQUIMICAS Y FARMACEUTICAS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE ROSARIO


Directed by
COMBINA, MARIANA
Scientific Research Career at CONICET

Co-directed by
FARBER, MARISA DIANA
Scientific Research Career at CONICET

Science and Technology Production

Services