NICOLAS PALOPOLI

PALOPOLI, NICOLAS

Adjunctive researcher

Speciality

Bioinformática y Biología Computacional

Scientific discipline

Biochemistry and Molecular Biology - Computer Science and Communications

Topic

Intrinsic disorder, conformational diversity and linear motifs in molecular interactions

Workplace

DEPARTAMENTO DE CIENCIA Y TECNOLOGIA

Dependencies

UNIVERSIDAD NACIONAL DE QUILMES

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Address:

ROQUE SAENZ PEÑA 352, 1876 - Bernal - Buenos Aires - Argentina

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Soy biotecnólogo por formación y me desempeño profesionalmente como biólogo computacional. Durante mi doctorado diseñé una herramienta computacional para la evaluación de modelos de estructura terciaria de proteínas mediante criterios evolutivos. Participé del proyecto de secuenciación, ensamblado y análisis de genoma de poroto común. Completé un postdoctorado en el desarrollo y aplicación de métodos computacionales para el estudio de motivos lineales cortos involucrados en el establecimiento d... Soy biotecnólogo por formación y me desempeño profesionalmente como biólogo computacional. Durante mi doctorado diseñé una herramienta computacional para la evaluación de modelos de estructura terciaria de proteínas mediante criterios evolutivos. Participé del proyecto de secuenciación, ensamblado y análisis de genoma de poroto común. Completé un postdoctorado en el desarrollo y aplicación de métodos computacionales para el estudio de motivos lineales cortos involucrados en el establecimiento de interacciones proteína-proteína. Actualmente continúo con esta línea de investigación como Investigador de CONICET para intentar mejorar la descripción estructural y la predicción computacional de motivos lineales y proteínas intrínsecamente desordenadas. Manejo bases de datos públicas y programas de aplicación general en el área de la bioinformática. Tengo experiencia en programación en lenguajes C, R y Python.

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Lines of Investigation

Bioinformática Estructural de Proteínas

Natural and exact sciences

Biological sciences
Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)

Desarrollo de métodos bioinformáticos basados en métodos evolutivos y estructurales para el estudio de proteínas

Natural and exact sciences

Biological sciences
Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythms), evolutionary biology

Biología Computacional

Natural and exact sciences

Computer and information sciences
Information sciences and bioinformatics (hardware development goes in 2.2 electrical, electronic and information engineering and social aspects go in 5.8 communication and media)

Interacciones proteína-proteína mediadas por motivos lineales cortos

Natural and exact sciences

Biological sciences
Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)

Technological Capacities

1 - Electronics, IT and Telecoms

1.2 - Information Processing, Information System, Workflow Management

1.2.10 - Databases, Database Management, Data Mining

1.3 - IT and Telematics Applications

1.3.1 - Applications for Health

5 - Physical and exact sciences

5.1 - Chemistry

5.1.2 - Computational Chemistry and Modelling

6 - Biological sciences

6.2 - Biology/Biotechnology

6.2.1 - Biochemistry/Biophysics
6.2.6 - Molecular design

6.3 - Genome Research

6.3.1 - Bioinformatics
6.3.2 - Gene Expression, Proteom Research

Key Words

COMPUTATIONAL BIOLOGYBIOLOGIA COMPUTACIONALPROTEIN-PROTEIN INTERACTIONSSHORT LINEAR MOTIFSMOTIVOS LINEALES CORTOSINTERACCIONES PROTEINA-PROTEINABIOINFORMATICSMOLECULAR EVOLUTIONPROTEIN STRUCTUREESTRUCTURA DE PROTEINASEVOLUCION MOLECULARBIOINFORMATICA

Education

2006 - 2011

Doctor con mención en Ciencias Básicas y Aplicadas

UNIVERSIDAD NACIONAL DE QUILMES

2001 - 2005

Licenciado en Biotecnología

UNIVERSIDAD NACIONAL DE QUILMES