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Estudio metagenómico de biodiversidad microbiana en muestras ambientales

Servicio tecnológico

Detalle
Análisis metagenómico de biodiversidad microbiana en muestras de suelo, agua, aire u otro contexto ambiental, orientado a empresas (por ejemplo, mineras) que necesiten detallar la biodiversidad de un territorio determinado. Se procede a la extracción del ADN con kits, a la posterior secuenciación, al procesamiento y análisis de los datos obtenidos.
Metodología
1. Se reciben muestras sólidas (suelo, salmueras, costras, sedimentos) o líquidas. Las mismas deben ser recolectadas en condiciones asépticas y colocadas en frascos o tubos estériles de 50 ml, con al menos la mitad del recipiente ocupado con muestra. Es preferible que para el muestreo lleven tubos con solución fijadora que deben ser retirados de CIME con antelación. En estos tubos deben poner una alícuota de las muestras recolectadas. Hacer llegar al CIME las muestras (tanto las fijadas como la... 1. Se reciben muestras sólidas (suelo, salmueras, costras, sedimentos) o líquidas. Las mismas deben ser recolectadas en condiciones asépticas y colocadas en frascos o tubos estériles de 50 ml, con al menos la mitad del recipiente ocupado con muestra. Es preferible que para el muestreo lleven tubos con solución fijadora que deben ser retirados de CIME con antelación. En estos tubos deben poner una alícuota de las muestras recolectadas. Hacer llegar al CIME las muestras (tanto las fijadas como las que colocadas en los frascos o tubos de recolección) en el lapso de las 24 a 48 hs de recolectadas. 2. En el caso de que se necesite analizar microorganismos en agua por microscopía electrónica, las muestras deben ser filtradas en el lugar por filtros Millipore 0.2 µm (por lo menos 3 litros de agua); estos filtros deben ser colocados en la solución de fijador provista y remitidos para el análisis. 3. Se prevé que los resultados podrán ser entregados ca. 35 días luego de la recepción de las muestras en CIME. Los tiempos pueden variar si hay problemas técnicos con los equipos y/o demoras en la disponibilidad de insumos por terceros.
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