Science and Technology Production
Congress
Authorship
Filippi, Carla V.
;
Sotelo, Mariana
;
Leonardi, Bernardina
;
Martinez, Mauro
;
AGUIRRE, NATALIA CRISTINA
;
Paniego, Norma
;
Borsani, Omar
Date
2025
Publishing House and Editing Place
REDBIO, REDTEZ y SAPROBIO
Summary
Information provided by the agent in
SIGEVA
La capacidad de las plantas para «recordar» exposiciones previas a condiciones adversas, conocida como memoria de estrés o priming, las prepara para una respuesta más eficiente ante eventos similares futuros. Evaluamos esta capacidad en plantas jóvenes de soja (Glycine max, estadio vegetativo V3) bajo un diseño experimental en dos etapas. En la primera, un grupo de plantas fue sometido a un episodio de estrés hídrico moderado (10 % de capaci...
La capacidad de las plantas para «recordar» exposiciones previas a condiciones adversas, conocida como memoria de estrés o priming, las prepara para una respuesta más eficiente ante eventos similares futuros. Evaluamos esta capacidad en plantas jóvenes de soja (Glycine max, estadio vegetativo V3) bajo un diseño experimental en dos etapas. En la primera, un grupo de plantas fue sometido a un episodio de estrés hídrico moderado (10 % de capacidad de campo durante tres días), mientras que otro grupo permaneció como control. Luego de un período de recuperación de siete días, ambos grupos fueron subdivididos: las plantas inicialmente control se dividieron en dos subgrupos, uno que permaneció como control (CC) y otro que fue sometido por primera vez a estrés (CE); a su vez, las plantas inicialmente estresadas se dividieron en un subgrupo que no volvió a ser estresado (EC) y otro que recibió un segundo evento de estrés (EE). Observamos mejores indicadores fisiológicos en las plantas que fueron previamente estresadas respecto de las que no lo fueron (LICOR 6800, DUAL-PAM). Esto sugiere la activación de mecanismos de memoria, posiblemente mediados por modificaciones epigenéticas, como la metilación del ADN y las marcas en la cromatina. Estudiar estos mecanismos epigenéticos resulta clave para comprender y aprovechar la resiliencia vegetal en un contexto de cambio climático. Sin embargo, los estudios epigenéticos como ChIP-seq (co-inmunoprecipitación de la cromatina, seguido de secuenciación) o WGBS (secuenciación a genoma completo con bisulfito) son costosos y, en muchos casos, deben externalizarse a centros de secuenciación internacionales. Esta centralización impone protocolos estandarizados con escasa posibilidad de adaptación a especies o preguntas específicas. Ante esta limitación, desarrollamos una estrategia de bajo costo basada en la adaptación del enfoque de genotipado por secuenciación con doble digestión enzimática (ddRADseq) para la detección de citosinas metiladas (5mC). Usando genomas disponibles en Ensembl Plants, realizamos simulaciones in silico con distintas combinaciones enzimáticas, evaluando rangos de selección de tamaño y su capacidad para cubrir regiones genómicas de interés (i.e. genes, transposones y sus regiones reguladoras). Logramos identificar, para cada especie, el par enzimatico y rango de size selection que maximizan el muestreo de las regiones de interés. En base a esas predicciones, y tomando a soja como caso de estudio, evaluamos los perfiles de metilación obtenidos para cada combinación enzimática y rango de selección de tamaño en los tres contextos de metilación en plantas (CG, CHG y CHH, H=A,T,C), encontrando diferencias significativas tanto en la cantidad como en la distribución de los sitios 5mC. Además, correlacionamos los perfiles obtenidos mediante ddRADseq5mC (en base a las condiciones predichas como óptimas), y los comparamos con los valores generados por WGBS (el gold standard para estudios de metilación), observando una alta concordancia entre ambos enfoques. Este trabajo destaca la importancia de optimizar las estrategias de epigenotipado según la especie y la pregunta biológica, y propone un enfoque escalable que puede contribuir al desarrollo de capacidades regionales para el estudio de la epigenética en cultivos de interés agronómico.
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Key Words
SOJACAPACIDADES REGIONALESEPIGENETICA