Science and Technology Production
Thesis
Authorship
Date
04/08/2025
Summary
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SIGEVA
Al día de hoy, diversos estudios de nuestro y otros laboratorios han reportado alteraciones en el proceso de splicing por infección viral, las cuales resultan de la combinación del impacto del virus sobre la maquinaria de splicing propiamente dicha con eventos que ocurren en la célula infectada, entre ellos la respuesta inmune innata (Pozzi et al., 2020; De Maio et al., 2016).En este trabajo, evaluamos cambios en los patrones de splicing compartidos entre la infecci&...
Al día de hoy, diversos estudios de nuestro y otros laboratorios han reportado alteraciones en el proceso de splicing por infección viral, las cuales resultan de la combinación del impacto del virus sobre la maquinaria de splicing propiamente dicha con eventos que ocurren en la célula infectada, entre ellos la respuesta inmune innata (Pozzi et al., 2020; De Maio et al., 2016).En este trabajo, evaluamos cambios en los patrones de splicing compartidos entre la infección con el virus del dengue y tratamiento con interferón de células en cultivo, siendo esto último una manera de activar la respuesta inmune innata en ausencia de virus. Entre los eventos compartidos, identificamos un aumento de isoformas de ARNm no codificantes provenientes del gen CLK1, que codifica para una quinasa de factores de splicing, entre ellos proteínas SR y la proteína spliceosomal U1-70K. Estas proteínas están involucradas en la regulación del proceso de splicing y su fosforilación por CLK1 afecta su reclutamiento a los speckles nucleares, reservorios dinámicos de factores de splicing que modulan la producción de isoformas de ARNm y consecuentemente la diversidad proteica (Aubol et. al, 2021). Luego de constatar la disminución de los niveles proteicos de CLK1 al tratar células en cultivo con interferón, nos propusimos analizar la inducción de genes de respuesta inmune en líneas estables donde los niveles de CLK1 fueron modulados mediante el sistema dCas9-KRAB/VP64. Observamos que la expresión de genes de respuesta inmune aumenta al silenciar CLK1, mientras que lo contrario ocurre al sobre-expresarla. También, analizamos la inducción de estos genes en presencia de TG003, inhibidor de la actividad quinasa de CLK1, y observamos que la inducción por tratamiento con interferón se exacerbaba. Por otro lado, medimos la replicación viral en presencia de TG003 en células infectadas con dengue. Notamos una disminución significativa de la carga viral, constatando que la modulación de los genes de respuesta a interferón por CLK1 puede tener un efecto anti-viral.
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Key Words
INTERFERONSPLICING ALTERNATIVOCLK1VIRUS DEL DENGUERESPUESTA INMUNE INNATA