Science and Technology Production
Journal of Basic & Applied Genetics - Desarrollo de una tecnica para el analisis de retrotransposones-LTR en el genoma de papa
Congreso
Authorship:
Arancibia, Celeste ; Cara, Nicolás ; Puebla, Andrea ; Zaballo, Diego ; Asurmendi, Sebastian ; Kozub, CArolina ; Calise, Claudio ; Gantuz, Magdalena ; BERTOLDI, MARIA VICTORIA ; Masuelli, RicardoDate:
2022Publishing House and Editing Place:
Sociedad Argentina de GeneticaISSN:
1852/6233Summary *
La poliploidización e hibridación son importantes mecanismos evolutivos de los genomas vegetales asociados a cambios genómicos estructurales, en especial a la activación de los elementos móviles transponibles (ETs), como los retrotransposones-LTR (RT-LTR). Esto provoca cambios genéticos y epigenéticos, re-arreglos cromosómicos, pérdida de segmentos y cambios en la metilación del ADN, entre otros.En papa (Solanum sp.), el estudio de la actividad los RT-LTRs es incipiente. En esteestudió se analizó los efectos de la hibridación y la poliploidización sobre la activación de RT-LTR y su efecto sobre la variabilidad genómica en papa. Se utilizaron alotetraploides del híbrido S. tuberosum x S. kurtzianum y autotetraploides de S. kurtzianum. Mediante S-SAP se estudiaron 10 RT-LTRs potencialmente activos. Se obtuvo de 48 a 118 fragmentos por RT-LTR. El híbrido compartió del 81% al 93% de los fragmentos con cada progenitor, quienes compartieron entre sí, del 46 al 59% de los fragmentos. Copia-27, 12, 14 y Gypsy-22 fueron los RT-LTRs más activos. El híbrido presentó fragmentos ausentes en los parentales. Los fragmentos presentes en los padres (y no en el híbrido) variaron del 3.22 a 18.37%. Las líneas alo y autotetraploides compartieron > 99,9% de los fragmentos con su progenitor diploide. Esto podría indicar que la hibridación interespecífica afecta la dinámica de RT-LTR s en mayor medida que la poliploidización. Nuestro modelo apoya la idea de que la hibridación actúa directamente sobre la activación de ET y que la poliploidización no sería relevante parala activación de RT-LTRs. Information provided by the agent in SIGEVAKey Words
LTRPOLIPLOIDIZACION