CONICET Community
Internal doctoral fellowship
Speciality
Ictiología
Scientific discipline
Biology
- Environment, Conservation and Sustainability
Topic
Study of the biodiversity and distribution of fish in rivers and estuaries of Tierra del Fuego using traditional methods and environmental DNA
Workplace
CENTRO AUSTRAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
(CADIC, CONICET)
Dependencies
- CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS
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| Address: |
| BERNARDO A. HOUSSAY 200, V9410CAB - Ushuaia - Tierra del Fuego - Argentina |
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Summary
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SIGEVA
Cuento con experiencia en diversas técnicas de biología molecular tales como diseño de cebadores para PCR y qPCR, extracción de ARN, tratamiento con DNAsas y retrotranscripción, amplificación de cDNA por PCR y qPCR, electroforesis en geles de agarosa, purificación y secuenciación de ADN y análisis de la expresión diferencial de genes por qPCR con el programa LinRegPCR. Análisis bioinformático de datos transcriptómicos mediante el ensamblado de novo del transcriptoma con Trinity y su posterior c...
Cuento con experiencia en diversas técnicas de biología molecular tales como diseño de cebadores para PCR y qPCR, extracción de ARN, tratamiento con DNAsas y retrotranscripción, amplificación de cDNA por PCR y qPCR, electroforesis en geles de agarosa, purificación y secuenciación de ADN y análisis de la expresión diferencial de genes por qPCR con el programa LinRegPCR. Análisis bioinformático de datos transcriptómicos mediante el ensamblado de novo del transcriptoma con Trinity y su posterior control de calidad con Bowtie, BLASTx local y BUSCO, cuantificación con Salmon y anotación mediante un BLASTx local. El análisis de expresión diferencial con DESeq2 y el enriquecimiento funcional en R. Cultivo in vitro de mioblastos. Análisis de caracteres morfométricos mediante cortes histológicos e ImageJ.Mantenimiento y manejo de peces en acuicultura. Biodiversidad mediante ADN ambiental (metabarcoding y especie-específico) Estudio de la historia de vida del salmón coho (Oncorhynchus kisutch), especie invasora en Tierra del Fuego.
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Lines of Investigation
Ontología muscular del pez teleósteo Pejerrey bonaerense (Odontesthes bonariensis)
Natural and exact sciences
- Biological sciences
- Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)
Estudio de la biodiversidad de peces de agua dulce en Tierra del Fuego mediante ADN ambiental y técnicas tradicionales.
Natural and exact sciences
- Biological sciences
- Biodiversity conservation
Historia de vida del salmón coho (Oncorhynchus kisutch) en Tierra del Fuego
Natural and exact sciences
- Biological sciences
- Ecology
Technological Capacities
6 - Biological sciences
6.2 - Biology/Biotechnology
- 6.2.2 - Cellular and Molecular Biology
- 6.2.4 - In vitro Testing, Trials
- 6.2.6 - Molecular design
6.3 - Genome Research
- 6.3.1 - Bioinformatics
- 6.3.2 - Gene Expression, Proteom Research
Key Words
TRANSCRIPTOMA MUSCULARODONTESTHES BONARIENSISMETABARCODINGAQUACULTUREADN AMBIENTALONCORHYNCHUS KISUTCHENVIRONMENTAL DNAMIOGÉNESISACUICULTURAMYOGENESISMUSCLE TRANSCRIPTOME
Education
2013 - 2022
Licenciado en Biotecnología
FACULTAD DE CIENCIAS BIOQUÍMICAS Y FARMACÉUTICAS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE ROSARIO
Directed by:
CHALDE, TOMAS
Scientific Research Career at CONICET
CHALDE, Tomas
Scientific Research Career at CONICET
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