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CARBONI, MARTÍN FEDERICO
Assistant professional
Topic:
- Asistencia en tareas computacionales y bioinformáticas a investigadores y becarios. Entre otras, incluye: búsqueda y procesamiento masivo de secuencias de bases de datos; ensamblado de secuencias provenientes de RNAseq y/o genomas, búsquedas de secuencias en base de datos, extracción de SNPs a partir de secuencias, instalación y puesta a punto de programas específicos. - Mantenimiento y desarrollo del sistema computacional local, incluyendo acceso a distancia a usuarios, instalación y administración de equipos de computación para análisis bioinformáticos (Debian based, Ubuntu). - Monitorización de equipos y redes. - Asistencia en la gestión interinstitucional del clúster computacional. - Asistencia en el desarrollo de ejercicios para cursos y materias relacionados al aprendizaje del uso de fuentes públicas de información y ciencias de datos. - Participación en escritura y corrección de artículos científicos resultantes de la investigación desarrollada.Workplace
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOLOGICAS (IIB, CONICET-UNMDP) Depends on
- CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS (CONICET)
- UNIVERSIDAD NACIONAL DE MAR DEL PLATA (UNMDP)
- FACULTAD DE CS.EXACTAS Y NATURALES
| Address: | |
| FUNES 3250, piso 4, 7600 - Mar del Plata - Buenos Aires - Argentina |
Contact:
S&T Expertise*
Soy Licenciado en Ciencias Biológicas y actualmente me desempeño como Profesional Asistente CPA-CONICET en el Museo Argentino de Ciencias Naturales en el área de Bioinformática. Cuento con un manejo fluido y amplia experiencia en administración de sistemas Linux/GNU y programas bioinformáticos (básicamente los que se necesiten usar), automatización en scripts en R y bash (algo en python también), exploración (y explotación) de bases de datos biológicas. Asisto a distintos grupos de investigación manteniendo varias lineas independientes y remotas a travez de trabajos en clusters mediante ssh o plataformas en linea como Google Colab. Además, cuento con conocimiento y experiencia en el desarrollo, captura y análisis de marcadores moleculares en varios modelos biológicos y su aplicación en el anclado de secuencias genómicas, identificación varietal, estudios de estructura poblacional, ensamblado de genomas, diversidad génica, filogenia, filogeografía, mapeo asociativo y transcriptómica. Manejo herramientas de diseño gráfico en mapa de bits y vectoriales, edición de video y sonido. *Information provided by the agent in SIGEVALines of Investigation
Desarrollo y de marcadores moleculas y análisis bioquímicos
Natural and exact sciences - Biological sciences - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)
Análisis de datós genómicos de poblaciones naturales
Natural and exact sciences - Computer and information sciences - Ciencias de la Información y Bioinformática (desarrollo de hardware va en 2.2 "Ingeniería Eléctrica, Electrónica y de Información" y los aspectos sociales van en 5.8 "Comunicación y Medios")
Technological Capacities
- 6. Biological sciences
- 2. Biology/Biotechnology
- 2.4. In vitro Testing, Trials
- 3. Genome Research
- 3.3. Population genetics
- 3.1. Bioinformatics
- 7. Agriculture and Marine Resources
- 1. Agriculture
- 1.4. Crop Production
Key Words
FILOGENÓMICAMAPEO ASOCIATIVOMOLECULAR MARKERSPHYLOGENOMICSPHYLOGEOGRAPHYFILOGEOGRAFÍAPOPULATION STRUCTUREASSOCIATION MAPINGMARCADORES MOLECULARESESTRUCTURA POBLACIONAL
Education
1999 - 2010
Licenciado en Ciencias Biológicas
UNIVERSIDAD NACIONAL DE MAR DEL PLATA
Science and Technology Production
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