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CONICET Community
PAOLINELLI, MARCOS

Assistant researcher

Speciality
Caracterización de la diversidad microbiana mediante técnicas moleculares
Scientific discipline
Agrarian Sciences - Biochemistry and Molecular Biology
Topic
Characterization of the Microbiome and Its Dynamics in the Soil-Plant-Fermentation Relationship for the Development of Sustainable Wine Production
Workplace
CENTRO DE ESTUDIOS ENOLOGICOS
Dependencies
  • INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGIA AGROPECUARIA
    • CENTRO REGIONAL MENDOZA-SAN JUAN (CR MENDOZA-SAN JUAN)
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Address:
SAN MARTIN 3855, 5507 - MAYOR DRUMMOND'S - Mendoza - Argentina
Summary Information provided by the agent in SIGEVA
Tengo experiencia en proyectos relacionados a las interacciones entre microorganismos y plantas, tanto aquellas de beneficio para ambas partes (rizobio-leguminosa), como las que causan un deterioro de la planta hospedadora (hongos de la familia Botrysophaeriaceae con vid). Durante estos proyectos puse en práctica técnicas de microbiología, biología molecular, bioquímica y bioinformática; como por ejemplo FPLC, HPLC, microscopía óptica, PCR, qPCR, RT-qPCR, RNAseq y metagenómica. En el doctorado ... Tengo experiencia en proyectos relacionados a las interacciones entre microorganismos y plantas, tanto aquellas de beneficio para ambas partes (rizobio-leguminosa), como las que causan un deterioro de la planta hospedadora (hongos de la familia Botrysophaeriaceae con vid). Durante estos proyectos puse en práctica técnicas de microbiología, biología molecular, bioquímica y bioinformática; como por ejemplo FPLC, HPLC, microscopía óptica, PCR, qPCR, RT-qPCR, RNAseq y metagenómica. En el doctorado profundicé más en la bioinformática, para lo cual utilicé los últimos desarrollos de software libre en Linux, lenguajes de programación en R, Perl y Python, así como el uso de clusters computacionales. En el postdoctorado lleve a cabo la caracterización del microbioma de plantas de vid cv. Malbec a partir de un enfoque metatranscriptómico. Actualmente estoy usando secuenciación de ONT (Oxford Nanopore Technologies) para la caracterización del microbioma de suelo y vino
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Lines of Investigation

Caracterizción del microbioma en plantas de vid cv. Malbec

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Cell biology, microbiology

Caracterización morfológica y molecular de hongos asociados a enfermedades de la madera en vid

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Mycology

Transcriptómica y expresión génica en hongos

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)

Caracterización del microbioma en vino

Agricultural sciences

  • Agricultural biotechnology
  • Agricultural biotechnology and food biotechnology

Caracterizción del microbioma en plantas de vid cv. Malbec

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Cell biology, microbiology

Transcriptómica y expresión génica en hongos

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)

Caracterización morfológica y molecular de hongos asociados a enfermedades de la madera en vid

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Mycology

Caracterización del microbioma en vino

Agricultural sciences

  • Agricultural biotechnology
  • Agricultural biotechnology and food biotechnology
Technological Capacities

6 - Biological sciences

6.2 - Biology/Biotechnology

  • 6.2.1 - Biochemistry/Biophysics
  • 6.2.2 - Cellular and Molecular Biology
  • 6.2.4 - In vitro Testing, Trials
  • 6.2.5 - Microbiology
  • 6.2.9 - Enzyme Technology
  • 6.2.11 - Protein Engineering

6.3 - Genome Research

  • 6.3.1 - Bioinformatics
  • 6.3.2 - Gene Expression, Proteom Research
  • 6.3.3 - Population genetics

6.4 - Micro- and Nanotechnology related to Biological sciences

7 - Agriculture and Marine Resources

7.1 - Agriculture

  • 7.1.3 - Biocontrol
  • 7.1.7 - Precision agriculture
Key Words
bioinformáticatranscriptomatranscriptomeenfermedades de la madera de vidmicrobiomamicrobiomegrapevine trunk diseasesbioinformaticssecuenciación con Tecnología ONTONT sequencing
Education

2012 - 2016

Doctor en Ciencias de la Vida con orientación en Microbiología

CICESE

2009 - 2011

Maestro en Biotecnología

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DEL ESTADO DE MORELOS

2001 - 2008

Licenciado en Biotecnología

FACULTAD DE CIENCIAS BIOQUIMICAS Y FARMACEUTICAS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE ROSARIO

HR Training
Directed by:
COMBINA, MARIANA
Scientific Research Career at CONICET
COMBINA, Mariana Scientific Research Career at CONICET
Co-directed by:
FARBER, MARISA DIANA
Scientific Research Career at CONICET
FARBER, Marisa Diana Scientific Research Career at CONICET
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