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GARAY, PABLO GERMAN

PROFESIONAL ASISTENTE

Topic:

Continuar con todas las tareas mencionadas anteriormente. Ampliar la colaboración con los grupos de investigación e integrantes del IMASL. Desarrollar tareas de auxiliar de docencia.

Workplace

INSTITUTO DE MATEMATICA APLICADA DE SAN LUIS "PROF. EZIO MARCHI" (IMASL, CONICET-UNSL) Depends on
Address:
ITALIA 1556, 5700 - San Luis - Argentina

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S&T Expertise*

Durante mi doctorado adquirí conocimientos en el uso del lenguaje Python, tanto en la realización de tareas rutinarias, como su uso en el cluster del IMASL para cálculo científico, búsquedas en bases de datos y manejo de grandes volúmenes de datos. Estas tareas las realice empleando, entre otros, PyMOL, NumPy, Pandas, Matplotlib, Seaborn, scikit-learn, Jupyter y PyMC3. Con este último (utilizado para realizar estadística Bayesiana) desarrollamos un método para la determinación de estructuras de glicanos a partir de los desplazamientos químicos de estas moléculas, para ello desarrollamos el paquete en Python CheSweet, disponible a través de GitHub. Actualmente desarrollo mi posdoctorado en el área de dinámicas moleculares de grano grueso, desarrollando parámetros para el campo de fuerza SIRAH. Para lo cual, además, utilizo Gromacs, VMD, y MDAnalysis, realizando cálculos en GPU en el ClusterUy. Asimismo manejo Markdown, Latex, Bash y tcl, y manejo fluidamente el inglés. *Information provided by the agent in SIGEVA

Lines of Investigation

Desarrollo de software CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias de la Computación e Información - Ciencias de la Información y Bioinformática (desarrollo de hardware va en 2.2 "Ingeniería Eléctrica, Electrónica y de Información" y los aspectos sociales van en 5.8 "Comunicación y Medios")
Bioinformática CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)
Estadísitica Bayesiana CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Matemáticas - Estadística y Probabilidad
Bioinformática CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias de la Computación e Información - Ciencias de la Información y Bioinformática (desarrollo de hardware va en 2.2 "Ingeniería Eléctrica, Electrónica y de Información" y los aspectos sociales van en 5.8 "Comunicación y Medios")
Biofísica CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Físicas - Otras Ciencias Físicas

Technological Capacities

  • 1. Electrónica, TICs y telecomunicaciones
    • 2. Procesado de información, Sistemas de información, Gestión de la carga de trabajo
      • 2.16. Simulaciones
      • 2.6. Software
      • 2.10. Bases de datos, gestión de bases de datos, extracción de datos
  • 5. Ciencias físicas y exactas
    • 1. Química
      • 1.2. Química computacional y modelado
      • 1.4. Química orgánica
  • 6. Ciencias biológicas
    • 1. Medicina, Salud humana
      • 1.1. Bioestadística, epidemiología
    • 2. Biología / Biotecnología
      • 2.2. Biología celular y molecular
      • 2.1. Bioquímica / biofísica
      • 2.6. Diseño molecular

Key Words

pythonestadística Bayesianaglicanosbig datacarbohidratesmolecular dynamicsdinámicas molecularesbases de datosglycansgrandes datosBayesian statisticscarbohidratosdata bases

Education

2014 - 2017

Doctor en Biología

FACULTAD DE QUIMICA, BIOQUIMICA Y FARMACIA, UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN LUIS

2003 - 2009

Licenciado en Biología Molecular

UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN LUIS


Science and Technology Production

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