CALLE 115 ENTRE 49 Y 50 S/N, 1900 - La Plata - Buenos Aires - Argentina
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Desde el inicio de mi formación me he dedicado a la investigación en el área de la microbiología agrícola, con particular interés en aspectos moleculares de la relación simbiótica entre rizobios y leguminosas. Para ello he aplicado diferentes métodos para la identificación de genes involucrados en etapas tempranas (colonización, competencia por el nicho simbiótico) de la interacción entre Sinorhizobium meliloti y alfalfa, en particular las tecnologías RIVET y STM. Esto ha requerido del desarrol...Desde el inicio de mi formación me he dedicado a la investigación en el área de la microbiología agrícola, con particular interés en aspectos moleculares de la relación simbiótica entre rizobios y leguminosas. Para ello he aplicado diferentes métodos para la identificación de genes involucrados en etapas tempranas (colonización, competencia por el nicho simbiótico) de la interacción entre Sinorhizobium meliloti y alfalfa, en particular las tecnologías RIVET y STM. Esto ha requerido del desarrollo de aplicaciones bioinformáticas para el procesamiento y análisis de datos de secuenciación masiva. He desarrollado scripts en R, PERL y linux Bash dedicados al análisis del sesgo en el uso de codones sinónimos en rizobios y otros organismos procariotas. Con estas herramientas hemos estudiado el uso de codones sinónimos en diferentes compartimentos genómicos, con interés especial en los plásmidos, y su adaptación a lo largo de la evolución. Actualmente, nuestro grupo utiliza diferentes herramientas bioinformáticas propias y de terceros para diferentes estudios a nivel genómico en procariotas.
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Lines of Investigation
Ecología de bacterias de importancia agrícola
Agricultural sciences
Agriculture, forestry, and fisheries
Agriculture
Análisis genómicos en rhizobios
Natural and exact sciences
Computer and information sciences
Information sciences and bioinformatics (hardware development goes in 2.2 electrical, electronic and information engineering and social aspects go in 5.8 communication and media)
Interacción simbiótica rhizobio-leguminosa
Natural and exact sciences
Biological sciences
Cell biology, microbiology
Technological Capacities
6 - Biological sciences
6.2 - Biology/Biotechnology
6.2.3 - Genetic Engineering
6.2.5 - Microbiology
6.3 - Genome Research
6.3.1 - Bioinformatics
Key Words
uso de codones sinonimosbioinformaticsRIVETSTMcodon usage biasbioinformaticaSinorhizobium melilotiSimbiosisSymbiosis