Caracterización bioinformática y molecular de los determinantes genéticos involucrados en la simbiosis rizobio-leguminosa y otras asociaciones planta-microorganismo.
CALLE 115 ENTRE 49 Y 50 S/N, 1900 - La Plata - Buenos Aires - Argentina
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ResumenInformación suministrada por el agente en SIGEVA
Desde el inicio de mi formación me he dedicado a la investigación en el área de la microbiología agrícola, con particular interés en aspectos moleculares de la relación simbiótica entre rizobios y leguminosas. Para ello he aplicado diferentes métodos para la identificación de genes involucrados en etapas tempranas (colonización, competencia por el nicho simbiótico) de la interacción entre Sinorhizobium meliloti y alfalfa, en particular las tecnologías RIVET y STM. Esto ha requerido del desarrol...Desde el inicio de mi formación me he dedicado a la investigación en el área de la microbiología agrícola, con particular interés en aspectos moleculares de la relación simbiótica entre rizobios y leguminosas. Para ello he aplicado diferentes métodos para la identificación de genes involucrados en etapas tempranas (colonización, competencia por el nicho simbiótico) de la interacción entre Sinorhizobium meliloti y alfalfa, en particular las tecnologías RIVET y STM. Esto ha requerido del desarrollo de aplicaciones bioinformáticas para el procesamiento y análisis de datos de secuenciación masiva. He desarrollado scripts en R, PERL y linux Bash dedicados al análisis del sesgo en el uso de codones sinónimos en rizobios y otros organismos procariotas. Con estas herramientas hemos estudiado el uso de codones sinónimos en diferentes compartimentos genómicos, con interés especial en los plásmidos, y su adaptación a lo largo de la evolución. Actualmente, nuestro grupo utiliza diferentes herramientas bioinformáticas propias y de terceros para diferentes estudios a nivel genómico en procariotas.
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Líneas de Investigación
Ecología de bacterias de importancia agrícola
Ciencias agrícolas
Agricultura, silvicultura y pesca
Agricultura
Análisis genómicos en rhizobios
Ciencias naturales y exactas
Ciencias de la computación e información
Ciencias de la información y bioinformática (desarrollo de hardware va en 2.2 ingeniería eléctrica, electrónica y de información y los aspectos sociales van en 5.8 comunicación y medios)
Interacción simbiótica rhizobio-leguminosa
Ciencias naturales y exactas
Ciencias biológicas
Biología celular, microbiología
Capacidades Tecnológicas
6 - Ciencias biológicas
6.2 - Biología / Biotecnología
6.2.3 - Ingeniería genética
6.2.5 - Microbiología
6.3 - Investigación del genoma
6.3.1 - Bioinformática
Palabras Clave
uso de codones sinonimosbioinformaticsRIVETSTMcodon usage biasbioinformaticaSinorhizobium melilotiSimbiosisSymbiosis