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GARAY, PABLO GERMAN

Assistant professional

Topic:

Tareas de Big Data, minería de datos, programación y desarrollo de modelos probabilísticos para el grupo GEA. Trabajo en el convenio entre APRHI (Córdoba) e IMASL-CONCIET a través del GEA. Realización de STANs. Participación en el Consejo directivo del IMASL y en la comisión de Seguridad e Higiene del IMASL. Desarrollo de tareas de docencia en la FCFMyN de la UNSL, en la Licenciatura de Gestión y Administración de Datos.

Workplace

INSTITUTO DE MATEMATICA APLICADA DE SAN LUIS "PROF. EZIO MARCHI" (IMASL, CONICET-UNSL) Depends on
Address:
ITALIA 1556, 5700 - San Luis - Argentina

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S&T Expertise*

Durante mi doctorado adquirí conocimientos en el uso del lenguaje Python, tanto en la realización de tareas rutinarias, como su uso en el cluster del IMASL para cálculo científico, búsquedas en bases de datos y manejo de grandes volúmenes de datos. Estas tareas las realice empleando, entre otros, PyMOL, NumPy, Pandas, Matplotlib, Seaborn, scikit-learn, Jupyter y PyMC3. Con este último (utilizado para realizar estadística Bayesiana) desarrollamos un método para la determinación de estructuras de glicanos a partir de los desplazamientos químicos de estas moléculas, para ello desarrollamos el paquete en Python CheSweet, disponible a través de GitHub. Actualmente desarrollo mi posdoctorado en el área de dinámicas moleculares de grano grueso, desarrollando parámetros para el campo de fuerza SIRAH. Para lo cual, además, utilizo Gromacs, VMD, y MDAnalysis, realizando cálculos en GPU en el ClusterUy. Asimismo manejo Markdown, Latex, Bash y tcl, y manejo fluidamente el inglés. *Information provided by the agent in SIGEVA

Lines of Investigation

Desarrollo de software Natural and exact sciences - Computer and information sciences - Ciencias de la Información y Bioinformática (desarrollo de hardware va en 2.2 "Ingeniería Eléctrica, Electrónica y de Información" y los aspectos sociales van en 5.8 "Comunicación y Medios")
Bioinformática Natural and exact sciences - Biological sciences - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)
Estadísitica Bayesiana Natural and exact sciences - Mathematics - Statistics and probability
Bioinformática Natural and exact sciences - Computer and information sciences - Ciencias de la Información y Bioinformática (desarrollo de hardware va en 2.2 "Ingeniería Eléctrica, Electrónica y de Información" y los aspectos sociales van en 5.8 "Comunicación y Medios")
Biophysics Natural and exact sciences - Physical sciences - Other physical sciences

Technological Capacities

  • 1. Electronics, IT and Telecoms
    • 2. Information Processing, Information System, Workflow Management
      • 2.16. Simulation
      • 2.6. Computer Software
      • 2.10. Databases, Database Management, Data Mining
  • 5. Physical and exact sciences
    • 1. Chemistry
      • 1.2. Computational Chemistry and Modelling
      • 1.4. Organic Chemistry
  • 6. Biological sciences
    • 1. Medicine, Human Health
      • 1.1. Biostatistics, Epidemiology
    • 2. Biology/Biotechnology
      • 2.2. Cellular and Molecular Biology
      • 2.1. Biochemistry/Biophysics
      • 2.6. Molecular design

Key Words

pythonestadística Bayesianaglicanosbig datacarbohidratesmolecular dynamicsdinámicas molecularesbases de datosglycansgrandes datosBayesian statisticscarbohidratosdata bases

Education

2014 - 2017

Doctor en Biología

FACULTAD DE QUIMICA, BIOQUIMICA Y FARMACIA, UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN LUIS

2003 - 2009

Licenciado en Biología Molecular

UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN LUIS


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