PAOLINELLI, MARCOS

Assistant researcher

SPECIALITY:

Caracterización de la diversidad microbiana mediante técnicas moleculares

Scientific discipline:

Agrarian Sciences - Biochemistry and Molecular Biology

Topic:

Soil microbiome characterization through high throughput sequencing for microbial terroir determination and diseases prevention on vitiviniculture

Workplace

CENTRO DE ESTUDIOS ENOLOGICOS Depends on

INSTITUTO NACIONAL DE TECNOLOGIA AGROPECUARIA (INTA)

CENTRO REGIONAL MENDOZA-SAN JUAN (CR MENDOZA-SAN JUAN)

ESTACION EXPERIMENTAL AGROPECUARIA MENDOZA (EEA MENDOZA)

	Address:
	SAN MARTIN 3855, 5507 - MAYOR DRUMMOND'S - Mendoza - Argentina

Contact:

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S&T Expertise*

Tengo experiencia en proyectos relacionados a las interacciones entre microorganismos y plantas, tanto aquellas de beneficio para ambas partes (rizobio-leguminosa), como las que causan un deterioro de la planta hospedadora (hongos de la familia Botrysophaeriaceae con vid). Durante estos proyectos puse en práctica técnicas de microbiología, biología molecular, bioquímica y bioinformática; como por ejemplo FPLC, HPLC, microscopía óptica, PCR, qPCR, RT-qPCR, RNAseq y metagenómica. En el doctorado profundicé más en la bioinformática, para lo cual utilicé los últimos desarrollos de software libre en Linux, lenguajes de programación en R, Perl y Python, así como el uso de clusters computacionales. En el postdoctorado lleve a cabo la caracterización del microbioma de plantas de vid cv. Malbec a partir de un enfoque metatranscriptómico. Actualmente estoy haciendo usando secuenciación de ONT (Oxford Nanopore Technologies) para lac caracterización del microbiomade suelo y vino *Information provided by the agent in SIGEVA

Lines of Investigation

Caracterizción del microbioma en plantas de vid cv. Malbec Natural and exact sciences - Biological sciences - Cell biology, microbiology

Caracterización morfológica y molecular de hongos asociados a enfermedades de la madera en vid Natural and exact sciences - Biological sciences - Mycology

Transcriptómica y expresión génica en hongos Natural and exact sciences - Biological sciences - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)

Caracterización del microbioma en vino Agricultural sciences - Agricultural biotechnology - Agricultural biotechnology and food biotechnology

Technological Capacities

6. Biological sciences

2. Biology/Biotechnology

2.1. Biochemistry/Biophysics
2.2. Cellular and Molecular Biology
2.4. In vitro Testing, Trials
2.5. Microbiology
2.9. Enzyme Technology
2.11. Protein Engineering

3. Genome Research

3.1. Bioinformatics
3.2. Gene Expression, Proteom Research
3.3. Population genetics

4. Micro- and Nanotechnology related to Biological sciences

7. Agriculture and Marine Resources

1. Agriculture

1.3. Biocontrol
1.7. Precision agriculture

Key Words

bioinformáticatranscriptomatranscriptomeenfermedades de la madera de vidmicrobiomamicrobiomegrapevine trunk diseasesbioinformaticssecuenciación con Tecnología ONTONT sequencing

Education

2012 - 2016

Doctor en Ciencias de la Vida con orientación en Microbiología

CICESE

2009 - 2011

Maestro en Biotecnología

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DEL ESTADO DE MORELOS

2001 - 2008

Licenciado en Biotecnología

FACULTAD DE CS.BIOQUIMICAS Y FARMACEUTICAS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE ROSARIO

Directed by

COMBINA, MARIANA

Scientific Research Career at CONICET

COMBINA, Mariana Scientific Research Career at CONICET

Co-directed by

FARBER, MARISA DIANA

Scientific Research Career at CONICET

FARBER, Marisa Diana Scientific Research Career at CONICET

Science and Technology Production

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