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SOSA PADILLA ARAUJO, BERNARDO

PROFESIONAL ADJUNTO

Topic:

-Asistir a los investigadores que lo soliciten, en el desarrollo de simulaciones computacionales moleculares y cálculos mecano-cuánticos. -Brindar capacitación y asesoramiento en el manejo de software específico y herramientas informáticas. -Ofrecer formaciones adicionales en el área de desempeño. -Participar en cursos de formación y perfeccionamiento relacionados. -Colaborar en el manejo y control de los recursos computacionales disponibles en el instituto. -Realizar el control de stock y actualización de insumos informáticos. -Apoyar a los investigadores que lo soliciten en el desarrollo de herramientas informáticas, análisis de datos estadísticos y almacenamiento de datos en las líneas de trabajo del instituto. -Integrar comisiones específicas para la gestión institucional de INQUINOA.

Workplace

INSTITUTO DE QUIMICA DEL NOROESTE (INQUINOA, CONICET-UNT) Depends on
Address:
AYACUCHO 471, T4000INI - San Miguel de Tucumán (Est. Tucumán) - Tucumán - Argentina

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S&T Expertise*

Técnicas Computacionales: Dinámica Molecular, Diseño Computacional de Proteínas, Diseño de Bibliotecas Genéticas, Modelaje Estructural Basado en Homología, Docking Molecular, Manejo de Bases de Datos Genéticas y Estructurales, Analisis Filogenticos, Data Mining, Diseño Computacional de Primers y Sondas de DNA para PCR, qPCR and RT-PCR. Lenguajes Informáticos: Unix, Linux, Python, R, Tcl, Perl, Matlab. Programas de Diseño y Modelaje Computacional: primer3, VMD, PyMOL, NAMD, AMBER, CHARMM, Maestro-Jaguar, REDS, Triad, Rosetta, Garli, Clustal Omega, Seaview, BioEdit. Tecnología de DNA: Biología Molecular, Clonación, Enzimas de Restricción, Secuenciación de DNA, Electroforesis, Purificación de DNA y RNA, Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR, RT-PCR, qPCR). Tecnología de Proteínas: Ingeniería de proteínas, Bioquímica y purificación de proteínas (Plataforma ÄKTA), SDS-PAGE, Cromatografía (Afinidad, Exclusión Molecular, Intercambio Iónico), Cinética Enzimática, Diseño de Ensayos Bioquímicos, Automatización (TECAN), Dicroísmo Circular, Determinación de Estabilidad de Proteínas *Information provided by the agent in SIGEVA

Lines of Investigation

Modelaje Computacional de Biomoleculas CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Biofísica
Biologia Estructural CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)
Bioinformatica CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias de la Computación e Información - Ciencias de la Información y Bioinformática (desarrollo de hardware va en 2.2 "Ingeniería Eléctrica, Electrónica y de Información" y los aspectos sociales van en 5.8 "Comunicación y Medios")
Diseño Computacional de Enzimas y Proteinas, Ingenieria de Proteinas CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)
Tecnologia de DNA y Proteinas. CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS - Ciencias Biológicas - Bioquímica y Biología Molecular (ídem 3.1.10)

Technological Capacities

  • 1. Electrónica, TICs y telecomunicaciones
    • 2. Procesado de información, Sistemas de información, Gestión de la carga de trabajo
      • 2.7. Tecnología informática / gráficos, meta informática
      • 2.10. Bases de datos, gestión de bases de datos, extracción de datos
      • 2.16. Simulaciones
  • 5. Ciencias físicas y exactas
    • 1. Química
      • 1.2. Química computacional y modelado
  • 6. Ciencias biológicas
    • 2. Biología / Biotecnología
      • 2.1. Bioquímica / biofísica
      • 2.2. Biología celular y molecular
      • 2.3. Ingeniería genética
      • 2.4. Ensayos in vitro, experimentos
      • 2.5. Microbiología
      • 2.6. Diseño molecular
      • 2.9. Tecnología de enzimas
      • 2.10. Biología sintética
      • 2.11. Ingeniería de proteínas
    • 3. Investigación del genoma
      • 3.1. Bioinformática
      • 3.2. Expresión genética, investigación proteómica
      • 3.3. Genética poblacional

Key Words

BioinformaticaDiseño Computacional de Enzimas Computational BiologyBiologia ComputacionalBioinformaticsBioinformatica EstrucuturalMolecular ModelingDiseño Computacional de ProteinasModelaje Computacional de Moleculas Simulacion Computacional de MoleculasStructural BioinformaticsProtein EngineeringComputational Protein Design Computational Enzyme Design Molecular SimulationsIngenieria de Proteinas

Education

2008 - 2014

Master of Science in Biochemistry and Molecular Biophysics

CALIFORNIA INSTITUTO OF TECHNOLOGY

2008 - 2014

Doctor of Philosophy in Biochemistry and Molecular Biophysics

CALIFORNIA INSTITUTO OF TECHNOLOGY

2002 - 2007

Licenciado en Quimica

FACULTAD DE BIOQUIMICA, QUIMICA Y FARMACIA, UNIVERSIDAD NACIONAL DE TUCUMAN


Science and Technology Production

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