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SOSA PADILLA ARAUJO, BERNARDO

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Topic
Asistir a los investigadores y becarios de INQUINOA que lo soliciten, en el desarrollo de simulaciones computacionales moleculares y cálculos mecano-cuánticos. Brindar capacitación y asesoramiento en el manejo de software específico y herramientas informáticas. Ofrecer formaciones adicionales en el área de desempeño. Participar en cursos de formación y perfeccionamiento relacionados. Colaborar en el manejo y control de los recursos computacionales disponibles en el instituto Realizar el co... Asistir a los investigadores y becarios de INQUINOA que lo soliciten, en el desarrollo de simulaciones computacionales moleculares y cálculos mecano-cuánticos. Brindar capacitación y asesoramiento en el manejo de software específico y herramientas informáticas. Ofrecer formaciones adicionales en el área de desempeño. Participar en cursos de formación y perfeccionamiento relacionados. Colaborar en el manejo y control de los recursos computacionales disponibles en el instituto Realizar el control de stock y actualización de insumos informáticos. Apoyar a los investigadores que lo soliciten en el desarrollo de herramientas informáticas, análisis de datos estadísticos y almacenamiento de datos en las diferentes líneas de trabajo del instituto. Integrar comisiones específicas para la gestión institucional de INQUINOA.
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Workplace
INSTITUTO DE QUIMICA DEL NOROESTE (INQUINOA, CONICET-UNT)
Dependencies
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Address:
AYACUCHO 471, T4000INI - San Miguel de Tucumán (Est. Tucumán) - Tucumán - Argentina
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Summary Information provided by the agent in SIGEVA
Técnicas Computacionales: Dinámica Molecular, Diseño Computacional de Proteínas, Diseño de Bibliotecas Genéticas, Modelaje Estructural Basado en Homología, Docking Molecular, Manejo de Bases de Datos Genéticas y Estructurales, Analisis Filogenticos, Data Mining, Diseño Computacional de Primers y Sondas de DNA para PCR, qPCR and RT-PCR. Lenguajes Informáticos: Unix, Linux, Python, R, Tcl, Perl, Matlab. Programas de Diseño y Modelaje Computacional: primer3, VMD, PyMOL, NAMD, AMBER, CHARMM, Maestr... Técnicas Computacionales: Dinámica Molecular, Diseño Computacional de Proteínas, Diseño de Bibliotecas Genéticas, Modelaje Estructural Basado en Homología, Docking Molecular, Manejo de Bases de Datos Genéticas y Estructurales, Analisis Filogenticos, Data Mining, Diseño Computacional de Primers y Sondas de DNA para PCR, qPCR and RT-PCR. Lenguajes Informáticos: Unix, Linux, Python, R, Tcl, Perl, Matlab. Programas de Diseño y Modelaje Computacional: primer3, VMD, PyMOL, NAMD, AMBER, CHARMM, Maestro-Jaguar, REDS, Triad, Rosetta, Garli, Clustal Omega, Seaview, BioEdit. Tecnología de DNA: Biología Molecular, Clonación, Enzimas de Restricción, Secuenciación de DNA, Electroforesis, Purificación de DNA y RNA, Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR, RT-PCR, qPCR). Tecnología de Proteínas: Ingeniería de proteínas, Bioquímica y purificación de proteínas (Plataforma ÄKTA), SDS-PAGE, Cromatografía (Afinidad, Exclusión Molecular, Intercambio Iónico), Cinética Enzimática, Diseño de Ensayos Bioquímicos, Automatización (TECAN), Dicroísmo Circular, Determinación de Estabilidad de Proteínas
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Lines of Investigation

Modelaje Computacional de Biomoleculas

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Biophysics

Biologia Estructural

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)

Bioinformatica

Natural and exact sciences

  • Computer and information sciences
  • Information sciences and bioinformatics (hardware development goes in 2.2 electrical, electronic and information engineering and social aspects go in 5.8 communication and media)

Diseño Computacional de Enzimas y Proteinas, Ingenieria de Proteinas

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)

Tecnologia de DNA y Proteinas.

Natural and exact sciences

  • Biological sciences
  • Biochemistry and molecular biology (same as 3.1.10)
Technological Capacities

1 - Electronics, IT and Telecoms

1.2 - Information Processing, Information System, Workflow Management

  • 1.2.7 - Computer Technology/Graphics, Meta Computing
  • 1.2.10 - Databases, Database Management, Data Mining
  • 1.2.16 - Simulation

5 - Physical and exact sciences

5.1 - Chemistry

  • 5.1.2 - Computational Chemistry and Modelling

6 - Biological sciences

6.2 - Biology/Biotechnology

  • 6.2.1 - Biochemistry/Biophysics
  • 6.2.2 - Cellular and Molecular Biology
  • 6.2.3 - Genetic Engineering
  • 6.2.4 - In vitro Testing, Trials
  • 6.2.5 - Microbiology
  • 6.2.6 - Molecular design
  • 6.2.9 - Enzyme Technology
  • 6.2.10 - Synthetic Biology
  • 6.2.11 - Protein Engineering

6.3 - Genome Research

  • 6.3.1 - Bioinformatics
  • 6.3.2 - Gene Expression, Proteom Research
  • 6.3.3 - Population genetics
Key Words
BioinformaticaDiseño Computacional de Enzimas Computational BiologyBiologia ComputacionalBioinformaticsBioinformatica EstrucuturalMolecular ModelingDiseño Computacional de ProteinasModelaje Computacional de Moleculas Simulacion Computacional de MoleculasStructural BioinformaticsProtein EngineeringComputational Protein Design Computational Enzyme Design Molecular SimulationsIngenieria de Proteinas
Education

2008 - 2014

Master of Science in Biochemistry and Molecular Biophysics

CALIFORNIA INSTITUTO OF TECHNOLOGY

2008 - 2014

Doctor of Philosophy in Biochemistry and Molecular Biophysics

CALIFORNIA INSTITUTO OF TECHNOLOGY

2002 - 2007

Licenciado en Quimica

FACULTAD DE BIOQUIMICA, QUIMICA Y FARMACIA, UNIVERSIDAD NACIONAL DE TUCUMAN

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